A Escola Básica e Secundária Dr. Manuel Fernandes foi intervencionada ao abrigo do Programa de Modernização do Parque Escolar destino ao Ensino Secundário. O projeto contemplou a construção de um novo edificio central, que alberga os serviços administrativos, salas de direção, a biblioteca e laboratórios.

O edificio do antigo colégio foi recuperado, para se adaptar às novas condições exigidas pela legislação. Funcionalmente, este corpo mantém-se inalterado, com salas de aula e salas de pequenos grupos, sala de música, núcleo de artes e sala de pausa de professores. No piso térreo encontra-se a cozinha, o refeitório, a cafetaria, salas para funcionários e espaços para alunos. Neste piso, existe um núcleo de ensino dedicado a alunos portadores de multideficiência, com fácil acesso a veículos pelo exterior.

O campo desportivo foi também intervencionado, criando-se uma cobertura e novos balneários, que servem os espaços desportivos exteriores.