O projeto de requalificação da Escola Básica e Secundária D. Filipa de Lencastre manteve a organização base do edifício existente, tendo-se procedido à sua reorganização interna.

As áreas administrativas e de gestão foram concentradas junto à entrada principal e as áreas sociais junto à zona desportiva. As restantes áreas foram ocupadas com espaços letivos.
O espaço da antiga biblioteca foi reconvertido em zona de professores e a biblioteca foi deslocada para o último piso acima da entrada principal. Foi feito o rebaixamento da cave do corpo do ginásio, permitindo a duplicação dos espaços desportivos. O terraço foi também recuperado para a prática desportiva.

Os espaços exteriores foram redesenhados, permitindo melhorar as condições de acessibilidade e aumentar a área permeável e arborizada.